Os objectivos que presidiram à elaboração do projecto de restauro do Jardim Botânico da Ajuda teve em conta a sua fortíssima herança como património histórico assim como a sua dupla função de espaço científico de estudo da Botânica e de espaço de lazer e animação turística e cultural. 

Pretendeu-se com a proposta: 

– Recuperar os elementos construídos que constituem o legado monumental do jardim: fontes, balaustradas, escadarias, pavimentos e bancos. 

– Recuperar o traçado original dos canteiros e a colecção de plantas no tabuleiro superior, atendendo à história da sua introdução em Portugal e à ligação aos descobrimentos portugueses, dispondo-as por áreas fitogeográficas. 

– Recuperar a colecção de plantas aquáticas no lago central do tabuleiro inferior. 

– Reactivar as estufas, reintroduzindo a produção de plantas. 

– Criar um jardim de plantas aromáticas desenhado para invisuais. 

– Recuperar a zona da mata com plantas representativas das associações da flora portuguesa. 

– Etiquetar as espécies expostas e editar o respectivo catálogo. 

– Reunir as condições essenciais para o acolhimento, apoio e enquadramento de visitantes. 

– Assegurar os meios necessários para permitir no futuro a obtenção de receitas que venham a garantir a manutenção do jardim. 

A abertura do jardim em 1997 fez aumentar o número de visitantes de 2000 para 20000 por ano, passando a ser conhecido e vivido.